MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7822 plasmid Cy782206

Total Repeats: 74

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014535	TTA	2	6	291	296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_014535	TACT	2	8	314	321	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_014535	TAG	2	6	354	359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014535	TTA	2	6	360	365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014535	CAA	2	6	380	385	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_014535	TTA	2	6	394	399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014535	TAA	2	6	515	520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014535	GTTAGG	2	12	633	644	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_014535	GGC	2	6	655	660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_014535	C	7	7	779	785	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
11	NC_014535	T	6	6	823	828	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014535	A	11	11	862	872	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014535	AT	4	8	886	893	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014535	ACA	2	6	970	975	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_014535	TAAAT	2	10	1018	1027	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014535	TAT	2	6	4928	4933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014535	ATTT	2	8	4969	4976	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014535	CAT	2	6	4978	4983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_014535	TAAT	2	8	5021	5028	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014535	TA	3	6	6938	6943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014535	TAA	2	6	6978	6983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014535	T	6	6	6984	6989	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014535	AATT	2	8	7009	7016	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014535	ACA	2	6	7112	7117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_014535	GAT	2	6	7130	7135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014535	TAA	2	6	7177	7182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014535	ATAA	2	8	7201	7208	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014535	TA	3	6	7217	7222	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014535	ATATTA	2	12	7240	7251	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014535	A	7	7	7345	7351	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_014535	TAA	2	6	7387	7392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_014535	TAA	2	6	7422	7427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_014535	A	6	6	7461	7466	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014535	TAA	2	6	7498	7503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014535	A	7	7	7604	7610	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014535	TG	3	6	7621	7626	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014535	TGC	2	6	7714	7719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_014535	T	7	7	7756	7762	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014535	A	6	6	7797	7802	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014535	T	6	6	8832	8837	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014535	TAA	2	6	8861	8866	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_014535	GTT	2	6	8902	8907	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014535	ATA	2	6	8943	8948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014535	TAGT	2	8	8949	8956	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014535	AAC	2	6	9356	9361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_014535	GTT	2	6	9377	9382	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_014535	TTA	2	6	9392	9397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_014535	CAT	2	6	10240	10245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_014535	GCTT	2	8	10252	10259	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_014535	ATA	2	6	10315	10320	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_014535	ACT	2	6	10324	10329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_014535	ACT	2	6	10353	10358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_014535	A	7	7	10376	10382	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_014535	TG	3	6	10391	10396	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014535	ATT	2	6	12393	12398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014535	TA	3	6	12445	12450	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_014535	ATTAA	2	10	12451	12460	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014535	ATTTA	2	10	12776	12785	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014535	TGT	2	6	12828	12833	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014535	TGAA	2	8	12841	12848	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014535	AAT	2	6	12873	12878	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014535	TA	4	8	12909	12916	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_014535	T	9	9	12933	12941	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_014535	G	7	7	13018	13024	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014535	TAT	2	6	13033	13038	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014535	GAT	2	6	13093	13098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014535	CTA	2	6	13148	13153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_014535	ACCCTA	2	12	13156	13167	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_014535	CCTTAA	2	12	13197	13208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_014535	AGC	2	6	13262	13267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_014535	TCG	2	6	13283	13288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_014535	TA	3	6	13613	13618	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014535	TA	3	6	13635	13640	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_014535	TA	3	6	13756	13761	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.